Мутация коронавируса: что известно о новом штамме, который испугал весь мир?

22 декабря 15:02

Мутация коронавируса: что известно о новом штамме, который испугал весь мир?

22 декабря 15:02

Коронавирус SARS-CoV-2, который вызывает COVID-19, мутирует так же, как и любой другой вирус. Это не новость, и мутации фиксировали все время его существования. Однако они не вызывали настолько нервную реакцию, как выявление B.1.1.7 или VUI-202012/01 (Variant Under Investigation – исследуемый вариант).

Власти Великобритании сообщили о том, что зафиксированная в стране мутация обладает повышенной заразностью. Европейские страны одна за другой закрывают авиасообщение и границы, в Великобритании ужесточают карантин.

Украинское небо для лайнеров из Британии не закрыли, а нашим гражданам лишь рекомендовали воздержаться от поездок в страну.

Nash.Live собрал основные сведения о B.1.1.7 или VUI-202012/01.

Содержание

Штамм коронавируса, вызывающего COVID-19, был выявлен в Ухане в декабре 2019 г. В ходе своего шествия по планете, он постоянно мутирует. Изначальный, L, в данный момент практически исчез. Кроме него есть еще семь основных штаммов: GR, G, GH, O, S, GV и V.

Филогению или развитие нового коронавируса, можно увидеть ниже.

Филогения штаммов

Филогения по регионам мира

Более детально изучить изменения коронавируса можно на платформе Nextstrain

То есть мутации отслеживаются и фиксируются постоянно. В октябре Консорциум COVID-19 Genomics UK секвенировал, то есть выявил последовательность нуклеотидов в ДНК, в двух образцах, взятых 20 и 21 сентября в Кенте и Лондоне. Данные образцы вызвали тревогу в связи с количеством мутаций и их локализацией.

Мы приведем цитаты из отчета о новом штамме. Первая – о необычно большом количестве мутаций B.1.1.7 (всего зафиксировано 17):

"Линия B.1.1.7 несет большее, чем обычно, количество вирусных генетических изменений. Накопление 14 замен аминокислот … на сегодняшний день является беспрецедентным в глобальных данных по вирусному геному для пандемии COVID-19. В большинстве ветвей глобального филогенетического дерева SARS-CoV-2 обнаружено не более нескольких мутаций, и мутации накапливаются с относительно постоянной скоростью с течением времени".

Вторая о локализации мутаций:

"B.1.1.7 имеет необычно большое количество генетических изменений, особенно в шиповом белке. Три из этих мутаций имеют потенциальные биологические эффекты".

Всего зафиксировано 17 мутаций. Одна, N501Y, увеличивает связку белка вируса с клетками человека. То есть может указывать на потенциально более высокую заразность и распространение. Ту же мутацию ранее обнаружили в геноме коронавируса в Южной Африке, в трех провинциях, Восточный Кейп, Западный Кейп и Квазулу-Натал, где количество заражений растет.

Есть и гипотеза о возникновении штамма, который обнаружили в Великобритании:

"Необычная генетическая дивергенция линии B.1.1.7 могла быть результатом, по крайней мере частично, эволюции вируса у хронически инфицированного человека".

Пока что в отношении нового штамма все прогнозы – теория. Эпидрасследование идет. Однако 14 декабря министр здравоохранения Великобритании Мэтт Хенкок сообщил о том, что вспышка заболеваемости на юго-востоке страны связана именно с этим штаммом. Также две трети заражений в Лондоне тоже связывают с ним.

Премьер-министр Борис Джонсон сообщил, что новая мутация увеличивает заразность на 70%. Речь идет об увеличении показателя R – репродуктивного числа. Это то количество людей, которое заразит один инфицированный. R не является постоянным числом. Показатель отличается от региона к региону. В Великобритании составляет 0,39, и если заразность нового штамма выше на 70%, то репродуктивное число может вырасти до 0,93%.

По данным Центра общественного здоровья Украины по состоянию на 21 декабря репродуктивное число составляет 0,91 и увеличение на 70% - это его рост до 1,5.

Данные о 70% - из презентации доктора Имперского колледжа Лондона Эрика Волца. 

Есть и данные о 67-75%, приведенные на основании расчетов британской консультативной группы по угрозам новых респираторных вирусов (NERVTAG). 

Пока что более высокая заразность штамма не доказана, а также нет точных данных и о том, что он более опасный.

"В настоящее время нет доказательств того, что этот штамм вызывает более тяжелые заболевания, хотя он обнаруживается в широкой географии", - цитирует медицинского советника NHS Test and Trace и Public Health England Сьюзан Хопкинс издание British Medical Journal.

Есть сухие цифры. Среди 915 случаев заражения новым штаммом зафиксировано четыре летальных и четыре повторных. Это данные NERVTAG. СМИ также цитируют представителей группы, которые сообщили о том, что новый штамм может вызвать большее количество заражений среди детей.

Растущее количество случаев среди молодежи зафиксировали в Южной Африке, где штамм вируса имеет ту же мутацию, что и B.1.1.7 – описанную нами выше N501Y. Но тут есть два нюанса. Во-первых, вспышка заболеваемости могла произойти в связи с массовыми празднованиями окончания экзаменов в Южной Африке. Во-вторых, предположение о потенциальных новых случаях у молодежи основывается и на том, что в принципе своем есть прогнозы о росте количества заражений.

Кроме Великобритании новый штамм обнаружили в Дании, Австралии, Нидерландах, Италии и Исландии. Возможно случаев больше, но далеко не везде ученые проводят секвенирование генома коронавируса. Издание Financial Times приводит слова Мадса Альбертсена, эксперта по микробной генетике из датского Университета Ольборга:  

"Если вы не будете искать, вы не найдете. Я не могу представить, чтобы он не распространился по всему миру, это кажется нереальным. Он так долго находится в Великобритании, что должен быть во всех странах".

Случаи заражения определили с помощью ПЦР-тестов, так что они работают. Есть мутация в спайковом белке, в одной из мишеней ПЦР-тестов. Однако тесты используют не одну, а две и более мишеней. В Великобритании и США, где определяют три и больше мишеней, потенциальных проблем с диагностикой не ждут.

"В Украине большинство тестов определяет две мишени в вирусе, и не затрагивают RBD участок вируса. Это значит, что риски того, что тесты не будут выявлять новый штамм крайне малы", - написал украинский генетик, основатель и научный директор лаборатории Diagen, Александр Коляда.

Судя по реакции главного санврача Виктора Ляшко, стопроцентного спокойствия нет. В конце декабря Центр общественного здоровья соберет производителей и поставщиков тест-систем ПЦР. Чтобы откорректировать тестирование и "добавить мишень, которая будет вылавливать белок нового вируса", как уточнил Ляшко.

Есть три ведущие вакцины, на закупки которых сейчас ориентированы развитые страны: Pfizer/BioNTech, Moderna и Oxford/AstraZeneca.

Оценки их эффективности при появлении нового штамма сдержанно оптимистические. В British Medical Journal считают маловероятным, что мутации в спайковом белке сделают вакцинацию неэффективной. Там указывают, что SARS-CoV-2 мутирует не так быстро, как вирус гриппа, и вакцины, которые до сих пор доказали свою эффективность в ходе испытаний, представляют собой такие типы, которые при необходимости можно легко изменить.

Но поскольку количество мутаций растет, в перспективе препараты придется корректировать. Это мы ежегодно проходим при вакцинации от сезонного гриппа. Он мутирует, и вакцину адаптируют.

Если Вы обнаружили ошибку в тексте, выделите ее мышью и нажмите Ctrl+Enter

Подпишитесь на НАШ в социальных сетях

Комментарии

фото пользователя
Для комментирования материала или зарегистрируйтесь
+ Больше комментариев

Новости партнеров

Загрузка...
^